Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd2Q149F1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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