Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms