Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Itgb8Q0VBD0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Itgb8Q0VBD0 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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