Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms