Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms