Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms