Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin2bQ01097 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms