Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms