Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
F8a1Q00558 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms