Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms