Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms