Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms