Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Otx2P80206 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Otx2P80206 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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