Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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