Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Acta1P68134 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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