Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms