Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms