Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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