Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CdaP56389 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CdaP56389 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CdaP56389 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CdaP56389 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CdaP56389 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CdaP56389 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CdaP56389 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CdaP56389 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CdaP56389 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms