Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NcanP55066 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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NcanP55066 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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NcanP55066 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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NcanP55066 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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NcanP55066 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NcanP55066 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NcanP55066 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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