Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CntfP51642 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CntfP51642 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CntfP51642 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CntfP51642 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CntfP51642 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CntfP51642 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CntfP51642 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CntfP51642 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CntfP51642 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CntfP51642 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CntfP51642 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CntfP51642 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CntfP51642 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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