Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VdrP48281 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms