Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Epb41P48193 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms