Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SrprbP47758 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SrprbP47758 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SrprbP47758 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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SrprbP47758 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SrprbP47758 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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SrprbP47758 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SrprbP47758 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SrprbP47758 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SrprbP47758 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SrprbP47758 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SrprbP47758 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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SrprbP47758 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SrprbP47758 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SrprbP47758 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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