Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rab20P35295 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab20P35295 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms