Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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CtgfP29268 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms