Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxraP28700 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxraP28700 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
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