Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NapbP28663 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NapbP28663 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NapbP28663 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NapbP28663 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NapbP28663 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NapbP28663 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NapbP28663 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NapbP28663 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NapbP28663 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NapbP28663 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NapbP28663 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NapbP28663 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NapbP28663 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NapbP28663 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NapbP28663 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms