Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl3P27659 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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