Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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PdgfraP26618 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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PdgfraP26618 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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