Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd8P23463 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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