Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PparaP23204 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PparaP23204 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms