Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Prim1P20664 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Krtap13-201ENSMUST00000053149 882 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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