Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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