Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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