Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P20040 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P20040 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P20040 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P20040 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P20040 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P20040 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P20040 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P20040 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P20040 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P20040 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P20040 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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