Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms