Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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