Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Spi1P17433 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spi1P17433 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Spi1P17433 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms