Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms