Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lnx1O70263 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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