Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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