Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms