Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vmn1r34G3XA52 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vmn1r34G3XA52 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vmn1r34G3XA52 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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