Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gm13497-201ENSMUST00000139497 2038 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20517G3UVU6 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Gm43615-201ENSMUST00000197465 1773 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20517G3UVU6 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms