Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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H2-M1F7CXU4 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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