Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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