Protein–RNA interactions for Protein: D3YXG0

Hmcn1, Hemicentin-1, mousemouse

Predictions only

Length 5,634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn1D3YXG0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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Hmcn1D3YXG0 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Olfr214-204ENSMUST00000215846 2605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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Hmcn1D3YXG0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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Hmcn1D3YXG0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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Hmcn1D3YXG0 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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Hmcn1D3YXG0 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Fam187b-202ENSMUST00000128384 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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Hmcn1D3YXG0 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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Hmcn1D3YXG0 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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Hmcn1D3YXG0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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Hmcn1D3YXG0 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Gimap8-203ENSMUST00000203509 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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Hmcn1D3YXG0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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Hmcn1D3YXG0 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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Hmcn1D3YXG0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Gm8704-201ENSMUST00000197181 435 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Gm43551-201ENSMUST00000197221 440 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Gm3922-201ENSMUST00000200519 435 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Klk4-201ENSMUST00000007161 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Adgrl2-203ENSMUST00000168352 2151 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hmcn1D3YXG0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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