Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms