Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms